目的　探讨转化医学理念结合病例讨论在胃肠外科临床教学中的应用。方法　第二军医大学临床医学本科系２００７、２００８级学员各１００名，每年级分为试验班５０名，对照班５０名；其中试验班又分为讨论班和综合班，各２５名。讨论班采用病例讨论教学进行授课，综合班采用转化医学理念结合标准化病例讨论教学法；对照班采用传统教学法。结果　试验班学员的成绩明显优于对照班；问卷调查显示９０％的学员认为综合教学法优于传统法。试验班较对照班对临床问题探索的兴趣显著增加（９０％ｖｓ．５０％）；医学职业的使命感和责任心明显加强（８６％ｖｓ．６４％）；科研思路的提炼能力明显提升（８０％ｖｓ．４８％）；自身能力和素质得到提高（７６％ｖｓ．５０％）；学习深度和广度明显增加（８０％ｖｓ．５２％）；自主学习与独立思考的意识增强（８８％ｖｓ．５４％）。其中综合班在科研思路、自身能力和素质以及学习的深度及广度、自主学习与独立思考方面进步更加明显。结论　转化医学结合病例讨论教学突破了传统教学法，更适应现代医学教学的要求，取得更好的教学效果，可在教学改革中进一步推广。