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1. 广州中医药大学深圳医院(福田)肿瘤三科
2. 江西中医药大学研究生院
3. 江西中医药大学附属医院肝胆科
Published:2023,
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[J]. (12):1433-1438(2023)
DOI:
[J]. (12):1433-1438(2023) DOI: 10.14009/j.issn.1672-2124.2023.12.005.
目的:运用网络药理学和数据挖掘技术,探索中药调控铁死亡干预肝硬化的用药规律,为肝硬化铁死亡的相关研究提供参考。方法:利用GeneCards、GeneCLiP3和FerrDb数据库获取铁死亡的强相关靶点,通过GeneCards和DisGeNET数据库获取肝硬化疾病靶点,两者映射得到肝硬化铁死亡的相关靶点;对潜在靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,选取Degree值≥2倍中位数的靶点(潜在靶点)通过中药系统药理学数据库与分析平台获取相关化合物和中药,利用R语言对潜在靶点进行相关机制分析;利用Cytoscape 3.7.2软件构建潜在靶点PPI网络图、靶点-化合物网络图、靶点-化合物-中药网络图;利用分子对接验证靶点与化合物以及中药核心成分的结合活性;借助中医传承辅助平台分析候选中药的性味归经及功效。结果:共得到肝硬化铁死亡相关靶点225个,Degree值≥36的肝硬化铁死亡的潜在靶点有47个,筛选得到146个化合物和284味中药,靶点与化合物及中药的核心成分结合较稳定,候选中药以寒性、苦味、入肝经、清热类、补虚类及活血化瘀类为主。结论:本研究从肝硬化和铁死亡的靶点出发,挖掘调控铁死亡干预肝硬化的中药及用药规律,也探讨了肝硬化铁死亡的相关作用机制,可为肝硬化铁死亡的相关研究提供参考。
铁死亡肝硬化网络药理学数据挖掘用药规律
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