Progress in mechanistic research on traditional Chinese medicine interventions for irritable bowel syndrome with diarrhea based on omics technologies

GAO Shanxue; MA Jiale; PENG Long; CHEN Jie

doi:10.6039/j.issn.1001-0408.2026.03.22

您当前的位置：

首页 >

文章列表页 >

Progress in mechanistic research on traditional Chinese medicine interventions for irritable bowel syndrome with diarrhea based on omics technologies

更新时间：2026-02-11

- Progress in mechanistic research on traditional Chinese medicine interventions for irritable bowel syndrome with diarrhea based on omics technologies
- ZHONGGUO YAOFANG Vol. 37, Issue 3, Pages: 401-406(2026)
- 作者机构：
  
  1.天津中医药大学研究生院，天津　301617
  2.天津中医药大学第二附属医院消化科，天津　300250
- 作者简介：
- 基金信息：
- DOI：10.6039/j.issn.1001-0408.2026.03.22
  CLC： R574.4;R256
- Received：13 September 2025，
  
  Revised：2025-12-28，
  
  Accepted：28 December 2025，
  
  Published：15 February 2026
- 稿件说明：
移动端阅览
高山雪,马佳乐,彭龙,等.基于组学技术的中医药干预腹泻型肠易激综合征机制研究进展[J].中国药房,2026,37(03):401-406.

GAO Shanxue,MA Jiale,PENG Long,et al.Progress in mechanistic research on traditional Chinese medicine interventions for irritable bowel syndrome with diarrhea based on omics technologies[J].ZHONGGUO YAOFANG,2026,37(03):401-406.
高山雪,马佳乐,彭龙,等.基于组学技术的中医药干预腹泻型肠易激综合征机制研究进展[J].中国药房,2026,37(03):401-406. DOI： 10.6039/j.issn.1001-0408.2026.03.22.

GAO Shanxue,MA Jiale,PENG Long,et al.Progress in mechanistic research on traditional Chinese medicine interventions for irritable bowel syndrome with diarrhea based on omics technologies[J].ZHONGGUO YAOFANG,2026,37(03):401-406. DOI： 10.6039/j.issn.1001-0408.2026.03.22.

摘要

腹泻型肠易激综合征（IBS-D）作为微生物群-肠-脑轴相关的典型疾病，其发病机制尚未完全明确，临床诊疗仍面临挑战。组学技术凭借高通量检测与系统性解析的优势，成为了解码中医药治疗IBS-D的复杂机制的关键工具。本文系统综述了转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组学及多组学整合技术在中医药干预IBS-D中的研究进展，发现在单一组学研究中，转录组学可通过RNA测序等技术，揭示中医药对IBS-D相关信号通路的调控机制；蛋白质组学可借助双向差异凝胶电泳、串联质谱标签等定量技术筛选出差异蛋白，阐明中医药治疗IBS-D的作用靶点；代谢组学可通过超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱质谱、液相色谱-串联质谱等方法，发现中医药改善IBS-D代谢紊乱的相关通路；微生物组学可基于16S RNA基因测序，证实中医药能重塑肠道菌群结构，恢复肠道微生态平衡，从而改善IBS-D。多组学整合研究能进一步突破单一组学局限，整合转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组学等多方面信息，更加全面、系统地阐释中医药治疗IBS-D的复杂机制。未来应从中医证型分层临床研究、多组学整合验证机制、新兴组学挖掘新机制三方面推进IBS-D相关研究，为该病的精准诊疗提供更多创新思路。

Abstract

Irritable bowel syndrome with diarrhea （IBS-D）， as a prototypical disorder involving the microbiota-gut-brain axis， remains poorly understood in terms of its pathogenesis， posing ongoing challenges for clinical diagnosis. Omics technologies， leveraging their high-throughput detection and systematic analysis advantages， has emerged as a critical tool for deciphering the complex mechanisms underlying traditional Chinese medicine （TCM） treatment of IBS-D. This systematic review summarizes the research progress of transcriptomics， proteomics， metabolomics， microbiomics， and multi-omics integration techniques in TCM interventions for IBS-D. In single-omics studies， transcriptomics using techniques like RNA-seq， reveals the regulatory mechanisms of TCM on IBS-related signaling pathways. Proteomics， leveraging quantitative technologies such as 2D-difference gel electrophoresis and tandem mass tag， identifies differentially expressed proteins and elucidates the action targets of TCM in treating IBS-D. Metabolomics， employing methods like UPLC-Q-TOF-MS and LC-MS/MS， discovers metabolic pathways regulated by TCM to improve metabolic disturbances in IBS-D. Microbiomics， based on 16S rRNA sequencing， confirms that TCM can reshape the gut microbiota structure and restore the intestinal microecological balance， thereby improving IBS-D. Multi-omics integration further overcomes the limitations of single-omics approaches by synthesizing information from transcriptomics， proteomics， metabolomics， and microbiomics， enabling a more comprehensive and systematic elucidation of the complex mechanisms underlying TCM treatment for IBS-D. In the future， research related to IBS-D should be advanced from three aspects： stratified clinical research based on TCM syndrome types， multi-omics integration verification mechanisms， and emerging omics to explore new mechanisms， providing more innovative ideas for the precise diagnosis and treatment of this disease.

关键词

Keywords

references

SHIN A ， KASHYAP P C . Multi-omics for biomarker approaches in the diagnostic evaluation and management of abdominal pain and irritable bowel syndrome：what lies ahead [J ] . Gut Microbes ， 2023 ， 15 （ 1 ）： 2195792 .

CHEN W Y ， LI T ， LIN Y K ， et al . Patchouli alcohol restores gut homeostasis in irritable bowel syndrome with diarrhea through myosin Ⅴa-mediated neurotransmitter regulation [J ] . Phytomedicine ， 2025 ， 141 ： 156681 .

CHAO G Q ， WANG Y Y ， YE F X ， et al . Regulation of colonic mucosal microRNA expression via multiple targets in visceral hypersensitivity rats by Tongxieyaofang [J ] . Yonsei Med J ， 2018 ， 59 （ 8 ）： 945 - 950 .

ZHANG Z R ， WU S ， STENOIEN D L ， et al . High-throughput proteomics [J ] . Annual Rev Anal Chem ， 2014 ， 7 ： 427 - 454 .

AMBERG A ， RIEFKE B ， SCHLOTTERBECK G ， et al . NMR and MS methods for metabolomics [J ] . Methods Mol Biol ， 2017 ， 1641 ： 229 - 258 .

REGUEIRA-IGLESIAS A ， BALSA-CASTRO C ， BLANCO-PINTOS T ， et al . Critical review of 16S rRNA gene sequencing workflow in microbiome studies：from primer selection to advanced data analysis [J ] . Mol Oral Microbiol ， 2023 ， 38 （ 5 ）： 347 - 399 .

DAVIDSON R M ， EPPERSON L E . Microbiome sequen- cing methods for studying human diseases [J ] . Methods Mol Biol ， 2018 ， 1706 ： 77 - 90 .

TAŞ N ， DE JONG A E ， LI Y M ， et al . Metagenomic tools in microbial ecology research [J ] . Curr Opin Biotechnol ， 2021 ， 67 ： 184 - 191 .

WEI Y Y ， FAN Y M ， HUANG S J ， et al . Baizhu shaoyao decoction restores the intestinal barrier and brain-gut axis balance to alleviate diarrhea-predominant irritable bowel syndrome via FoxO1/FoxO3a [J ] . Phytomedicine ， 2024 ， 122 ： 155163 .

GUO Y J ， LU Q Q ， YANG X J ， et al . Efficacy of Shu-Yi-Ning-Chang decoction on IBS-D：modulating Nr4a3 pathway to reduce visceral hypersensitivity [J ] . PLoS One ， 2024 ， 19 （ 4 ）： e0299376 .

YU J Y ， LI X ， SUN Y T ， et al . Transcriptomic analysis and experiment to verify the mechanism of Xiaoyao San in the treatment of irritable bowel syndrome with depression [J ] . J Ethnopharmacol ， 2025 ， 347 ： 119732 .

ZHANG Y N ， HUANG S J ， ZHANG S ， et al . Pomegra- nate peel extract mitigates diarrhea-predominant irritable bowel syndromes via MAPK and NF-κB pathway modulation in rats [J ] . Nutrients ， 2024 ， 16 （ 22 ）： 3854 .

常晓丽，王丽君，张丽丽，等 . 基于转录组测序技术探讨电针“天枢”“大肠俞”改善炎症后肠易激综合征大鼠内脏高敏感性的机制 [J/OL ] . 中国针灸， 2025 ： 1 - 12 [ 2025-09-13 ] . https：//doi.org/10.13703/j.0255-2930.20250228-k0001 https://doi.org/10.13703/j.0255-2930.20250228-k0001 .

LIN Y J ， DING Y ， LÜ B ， et al . Effect of Tongxieyaofang decoction on colonic mucosal protein expression profiles in rats with visceral hypersensitivity [J ] . J Tradit Chin Med ， 2020 ， 40 （ 2 ）： 245 - 252 .

张喆，李依洁，魏玮，等 . 温肾健脾方对脾肾阳虚证腹泻型肠易激综合征大鼠模型肠组织蛋白组学的影响 [J ] . 中国临床保健杂志， 2021 ， 24 （ 4 ）： 507 - 511 .

陈璇，杨欣，于晓雯，等 . 痛泻要方对腹泻型肠易激综合征大鼠粪便代谢组学的影响 [J ] . 现代中西医结合杂志， 2023 ， 32 （ 1 ）： 38 - 44 .

ZHANG Z ， YANG S S ， LIN X ， et al . Metabolomics of Spleen-Yang deficiency syndrome and the therapeutic effect of Fuzi lizhong pill on regulating endogenous metabolism [J ] . J Ethnopharmacol ， 2021 ， 278 ： 114281 .

ZHU J ， ZOU Y X ， WU Y G ， et al . Exploring the mechanism of action of honeybran-fried Cimicifuga Rhizoma in the treatment of IBS-D based on metabolomics and network pharmacology [J ] . Biomed Chromatogr ， 2025 ， 39 （ 5 ）： e70026 .

刘涛，伍梦玲，邓国艳，等 . 乌药水提物干预腹泻型肠易激综合征大鼠的血清代谢组学研究 [J ] . 中国中药杂志， 2023 ， 48 （ 19 ）： 5356 - 5364 .

刘窈玉，穆芳园，王一程，等 . 蜘蛛香提取物治疗腹泻型肠易激综合征模型大鼠粪便UPLC-MS/MS代谢组学研究 [J ] . 中国中药杂志， 2021 ， 46 （ 3 ）： 678 - 684 .

梅佳华，郝佳旭，姜婕，等 . 基于血清代谢组学探讨复方蜘蛛香凝胶贴膏治疗腹泻型肠易激综合征的作用机制 [J/OL ] . 时珍国医国药， 2025 ： 1 - 8 [ 2025-09-13 ] . https：//link.cnki.net/urlid/42.1436.r.20250521.1112.002 https://link.cnki.net/urlid/42.1436.r.20250521.1112.002 .

付伊萌，梁凤霞，李佳，等 . 基于TM广靶代谢组学探讨标本配穴针灸对肠易激综合征大鼠代谢模式的影响 [J ] . 针刺研究， 2023 ， 48 （ 4 ）： 339 - 346，352 .

邱宇驰，韩红伟，张家玮，等 . 基于代谢组学技术探究针灸抑制腹泻型肠易激综合征模型大鼠肠道炎症反应的作用机制 [J ] . 环球中医药， 2024 ， 17 （ 3 ）： 384 - 392 .

CHEN Y ， XIAO S M ， GONG Z P ， et al . Wuji Wan formula ameliorates diarrhea and disordered colonic motility in post-inflammation irritable bowel syndrome rats by modulating the gut microbiota [J ] . Front Microbiol ， 2017 ， 8 ： 2307 .

ZHANG Z ， LIN X ， HUANG Y ， et al . An integrated gut microbiota and network pharmacology study on Fuzi-lizhong pill for treating diarrhea-predominant irritable bowel syndrome [J ] . Front Pharmacol ， 2021 ， 12 ： 746923 .

ZHAO Y C ， ZHAN J G ， SUN C Y ， et al . Sishen Wan enhances intestinal barrier function via regulating endoplasmic reticulum stress to improve mice with diarrheal irritable bowel syndrome [J ] . Phytomedicine ， 2024 ， 129 ： 155541 .

LIAN Q H ， DING H Y ， ZHU H P ， et al . Study of Jianpi mixture on intestinal microbiota of diarrhea irritable bowel syndrome mice [J ] . Evid Based Complement Alternat Med ， 2020 ， 2020 ： 5241308 .

裴文婧，谢春娥，李军祥，等 . 痛泻安肠方对腹泻型肠易激综合征小鼠内脏高敏及肠道菌群的影响 [J ] . 中国中西医结合消化杂志， 2023 ， 31 （ 1 ）： 37 - 44 .

SUN J ， ZHANG M Q ， LIU W ， et al . Evaluation of the effectiveness and mechanism of action of the Chang-Kang-Fang formula combined with bifid triple viable capsules on diarrhea-predominant irritable bowel syndrome [J ] . Front Microbiol ， 2023 ， 14 ： 1160783 .

黎豫川，张远哲，杨元凤，等 . 白术-木香药对对脾虚腹泻型肠易激综合征大鼠肠道菌群与短链脂肪酸代谢的调节作用 [J ] . 中国药房， 2024 ， 35 （ 3 ）： 304 - 310 .

LI L ， CUI H R ， LI T ， et al . Synergistic effect of berberine-based Chinese medicine assembled nanostructures on diarrhea-predominant irritable bowel syndrome in vivo [J ] . Front Pharmacol ， 2020 ， 11 ： 1210 .

赖碧玉，洪梦颖，何永嘉，等 . 基于16S rDNA技术探讨针灸对腹泻型肠易激综合征模型大鼠肠道菌群的影响 [J ] . 中国针灸， 2023 ， 43 （ 12 ）： 1411 - 1421 .

王婧雯，郑淑霞，林晟，等 . 基于16S rDNA高通量测序研究电针对腹泻型肠易激综合征大鼠肠道菌群的调节作用 [J ] . 环球中医药， 2023 ， 16 （ 5 ）： 846 - 851 .

LI Y G ， CHEN Y Y ， LIAO Z Y ， et al . Wentongganpi decoction alleviates diarrhea-predominant irritable bowel syndrome by improving intestinal barrier [J ] . J Ethnopharmacol ， 2024 ， 334 ： 118544 .

HANG L ， WANG E K ， FENG Y ， et al . Metagenomics and metabolomics analysis to investigate the effect of Shugan decoction on intestinal microbiota in irritable bowel syndrome rats [J ] . Front Microbiol ， 2022 ， 13 ： 1024822 .

LING X W ， PENG S Y ， ZHONG J B ， et al . Effects of Chang-Kang-Fang formula on the microbiota-gut-brain axis in rats with irritable bowel syndrome [J ] . Front Pharmacol ， 2022 ， 13 ： 778032 .

文娜，胡运莲，唐镔镔，等 . 基于多组学分析粪菌移植和葛根芩连汤对湿热证腹泻型肠易激综合征大鼠的影响 [J ] . 联勤军事医学， 2025 ， 39 （ 3 ）： 183 - 193，220 .

Views

下载量

CSCD

Alert me when the article has been cited

提交

Tools

Publicity Resources

Research progress on the mechanisms of traditional Chinese medicine in treating functional constipation based on the gut microbiota-bile acid axis

中医药辅助治疗哮喘合并过敏性鼻炎的疗效观察

补中益气五苓汤结合西医治疗慢性心力衰竭的临床观察

中医药治疗黄褐斑的文献计量分析

代谢组学研究的文献计量分析

Related Author

ZHANG Hongxi

ZHANG Yang

SHI Yu

LIANG Yong

ZOU Yue

ZHANG Qimeng

KONG Xiangrui

ZHANG Qianshu

Related Institution

Graduate School， Liaoning University of Traditional Chinese Medicine

Dept. of Anorectal Surgery， the Third Affiliated Hospital of Liaoning University of Traditional Chinese Medicine

⁰