Remodeling characteristics of super-enhancers in intestinal gastric cancer and their roles in upregulating
CEMIP expression- Journal of Army Medical University Vol. 47, Issue 5, Pages: 396-406(2025)
- 作者机构：
1.重庆大学医学院，重庆
2.陆军特色医学中心（第三军医大学大坪医院）消化内科，消化系统肿瘤精准防治重庆市重点实验室，重庆
- 作者简介：
- 基金信息：the National Natural Science Foundation for Excellent Young Scientists of China(81822032);the Natural Science Foundation for Distinguished Young Scholars of Chongqing(CSTC2019JCYJJQX0027)
DOI：10.16016/j.2097-0927.202407057
CLC： R394.3;R730.23;R735.2Received：15 July 2024，
Revised：23 October 2024，
Published：15 March 2025
- 稿件说明：
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彭仕银，谭玉婷，薛锐，等.肠型胃癌的超级增强子重塑特征及上调迁移诱导蛋白CEMIP表达的作用研究［J］.陆军军医大学学报，2025，47（05）：396-406.DOI：10.16016/j.2097-0927.202407057.
PENG S Y，TAN Y T，XUE R，et al.Remodeling characteristics of super-enhancers in intestinal gastric cancer and their roles in upregulating CEMIP expression［J］.J Army Med Univ，2025，47（5）：396-406.DOI：10.16016/j.2097-0927.202407057.
彭仕银，谭玉婷，薛锐，等.肠型胃癌的超级增强子重塑特征及上调迁移诱导蛋白CEMIP表达的作用研究［J］.陆军军医大学学报，2025，47（05）：396-406.DOI：10.16016/j.2097-0927.202407057. DOI：
PENG S Y，TAN Y T，XUE R，et al.Remodeling characteristics of super-enhancers in intestinal gastric cancer and their roles in upregulating CEMIP expression［J］.J Army Med Univ，2025，47（5）：396-406.DOI：10.16016/j.2097-0927.202407057. DOI：
摘要
目的
2
绘制肠型胃癌的超级增强子重塑图谱，揭示超级增强子的肿瘤生物学功能及可能激活的下游靶基因。
方法
2
收集陆军特色医学中心消化内科2022年1-12月收治行内镜检查、治疗的患者的31例正常胃黏膜组织、23例肠型胃癌组织及9例肠型胃癌类器官进行靶向组蛋白H3K27ac修饰的染色质靶向捕获（cleavage under targets and tagmentation， CUT&Tag）测序，基于生物信息学工具描绘肠型胃癌的超级增强子重塑特征并鉴定关键靶基因；利用CRISPRi技术干预超级增强子，Western blot检测靶基因的表达，并采用CCK-8法和Transwell迁移、侵袭实验检测对照组细胞及干预组细胞的增殖、迁移、侵袭能力。
结果
2
肠型胃癌组织与正常胃黏膜组织超级增强子信号差异明显（
P
<
0.05），癌组织中的活性超级增强子可能参与免疫系统的负向调节、细胞黏附等生物学过程；在肿瘤细胞中表达上调的细胞迁移诱导蛋白（cell migration-inducing protein，CEMIP）受到超级增强子的调控，干预超级增强子后肿瘤细胞CEMIP蛋白表达量下降（
P
<
0.05），细胞增殖率、相对迁移面积和相对侵袭面积也随之下降 （
P
<
0.05）。
结论
2
肠型胃癌发生了超级增强子重塑，其下游靶基因
CEMIP
可促进癌细胞生长、迁移和侵袭。
Abstract
Objective To map the super-enhancers remodeling of intestinal gastric cancer and reveal the tumor biological functions of the super-enhancers and the downstream target genes that may be activated. Methods A total of 31 normal gastric mucosal tissues， 23 intestinal gastric cancer tissues and 9 intestinal gastric cancer organoids were collected from the Department of Gastroenterology of Army Medical Center of PLA from January to December 2022. Chromatin targeting histone H3K27ac modified chromatin targeting cleavage under targets and tagmentation （CUT
&
Tag） sequencing was conducted on above tissues. The remodeling profiles of super-enhancers in intestinal gastric cancer were analyzed and the key target genes were identified based on bioinformation tools. CRISPRi technology was used to intervene with the super-enhancers， the expression of target genes was detected with Western blotting， and the proliferation， migration and invasion abilities were detected by CCK-8 assay an
d Transwell chambers in the control group and the intervention group. Results There was a significant difference in the signal of super-enhancers between intestinal gastric cancer tissues and normal gastric mucosal tissues （
P
<
0.05）， and the active super-enhancers in cancer tissues may be involved in biological processes such as negative regulation of the immune system and cell adhesion. The expression of up-regulated cell migration-inducing protein （
CEMIP
） in tumor cells was regulated by the super-enhancers， and intervening the super-enhancers down-regulated the expression of
CEMIP
（
P
<
0.05）， and inhibited the cell proliferation， invasion and migration abilities of tumor cells （
P
<
0.05）. Conclusion Super-enhancer remodeling is observed in intestinal gastric cancer， and they can up-regulate the expression of
CEMIP
gene and promote the growth， migration and invasion of cancer cells.
关键词
Keywords
references
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