铜绿假单胞菌噬菌体PaP3的密码使用偏嗜性与tRNA基因

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铜绿假单胞菌噬菌体PaP3的密码使用偏嗜性与tRNA基因

更新时间：2026-01-09

- 铜绿假单胞菌噬菌体PaP3的密码使用偏嗜性与tRNA基因
- Journal of Army Medical University Vol. 24, Issue 4, (2002)
- 作者机构：
- 作者简介：
- 基金信息：
- DOI：10.16016/j.1000-5404.2002.04.004
  CLC： Q933
- Online First：30 April 2002，
  
  Published：2002
- 稿件说明：
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张克斌,金晓琳,陈志瑾,朱军民,饶贤才,胡福泉,铜绿假单胞菌噬菌体PaP3的密码使用偏嗜性与tRNA基因[J].陆军军医大学学报(原第三军医大学学报),2002,24(04):0-.

张克斌, 金晓琳, 陈志瑾, et al. 铜绿假单胞菌噬菌体PaP3的密码使用偏嗜性与tRNA基因[J]. Journal of Army Medical University, 2002, 24(4).
张克斌,金晓琳,陈志瑾,朱军民,饶贤才,胡福泉,铜绿假单胞菌噬菌体PaP3的密码使用偏嗜性与tRNA基因[J].陆军军医大学学报(原第三军医大学学报),2002,24(04):0-. DOI：10.16016/j.1000-5404.2002.04.004

张克斌, 金晓琳, 陈志瑾, et al. 铜绿假单胞菌噬菌体PaP3的密码使用偏嗜性与tRNA基因[J]. Journal of Army Medical University, 2002, 24(4). DOI： 10.16016/j.1000-5404.2002.04.004.

摘要

目的　检索分析铜绿假单胞菌噬菌体PaP3的遗传密码使用偏嗜性及其tRNA基因的关系。方法　利用生物信息学软件和网上生物信息学工具

检索分析PaP3的遗传密码使用偏嗜性 ;并与铜绿假单胞菌PAO1的遗传密码使用偏嗜性进行对比分析 ;检索PaP3基因组中tRNA基因并分析其与遗传密码使用偏嗜性的关系。结果　遗传密码偏嗜性分析发现噬菌体PaP3和铜绿假单胞菌优势码一致的氨基酸有F uuc

I auc

V guc

A gcc

Y uac

H cac

N aac

K aag和T acc ;PaP3单独具有偏嗜性密码的氨基酸有A gcu

G ggu

T acu和V gua ;铜绿假单胞菌PAO1单独具有偏嗜性密码的氨基酸有L cug

V gug

P ccg

V gcg

Q cag

D gac

E gag

C ugc

R cgc

S agc和G ggc。tRNA基因查询发现了PaP3基因组中存在三段tRNA编码序列

分别编码tRNAAsn

tRNAAsp

tRNAPro;它们的反密码子分别为“gtt”

“gtc”和“tgg”

分析结果没有表明这三个tRNA基因与优势转运氨基酸有关。结论　铜绿假单胞菌PAO1的遗传密码偏嗜性更为明显

而PaP3的遗传密码偏嗜性相对较弱

两者在遗传密码偏嗜性方面并未表现出一致性 ;噬菌体编码的tRNA基因与遗传密码偏嗜性之间有直接联系

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